| 1995-23B | Monitoreo de la marea roja en las aguas interiores de las X y XI Regiones | Universidad Austral de Chile | Terminado | --- | Informe final: Monitoreo de la marea roja en las aguas interiores de las X y XI Regiones |
| 1995-23A | Monitoreo de la marea roja en las aguas interiores de la XII Región | Universidad de Magallanes | Terminado | --- | Informe final: Monitoreo de la marea roja en las aguas interiores de la XII Región |
| 1993-16 | Monitoreo mensual de la marea roja en la XI y XII Regiones | Universidad de Magallanes | Terminado | --- | Informe Final : MONITOREO MENSUAL DE LA MAREA ROJA EN LA XI Y XII REGIONES |
| 2020-15 | Determinación y caracterización de floraciones de algas nocivas, etapa 1: Microalgas nocivas para las especies hidrobiológicas y la acuicultura | Universidad de Valparaíso | Término anticipado contrato | Plaga:Alexandrium catenella | |
| 2017-38 | Identificación de los principales agentes patógenos en Seriola y Corvina sometidas a cultivo intensivo | | Licitación desierta | Peces - Corvina | |
| 2017-29 | Determinación y aplicación de Indicadores operacionales de bienestar animal en salmónidos cultivados en agua dulce | Universidad Austral de Chile | Terminado | Peces - Salmón | Informe Final : Determinación y aplicación de Indicadores operacionales de bienestar animal en salmónidos cultivados en agua dulce |
| 2015-12 | Investigación en factores epidemiológicos, de patogenicidad, desarrollo, validación y control de técnicas de diagnóstico para la Anemia Infecciosa del Salmón y Piscirickettsiosis | Pontificia Universidad Católica de Valparaíso | Terminado | Peces - Salmón | Informe final |
| 2021-38 | Caracterización ecológica y bioquímica de las algas verdes filamentosas tipo Rhizoclonium, en las áreas de plaga declaradas de acuerdo con el D.S. (MINECON) Nº 345 de 2005, y propuestas de potenciales usos productivos | Universidad Arturo Prat | Terminado | Algas | Informe final |
| 2023-17 | Evaluación de las biotoxinas marinas en la zona norte de Chile | Instituto de Fomento Pesquero | En ejecución | --- | |
| 2024-15 | Determinar el nivel de concentración de las especies de arsénico III y V, presentes en el arsénico inorgánico total, en recursos hidrobiológicos de interés | | Licitación desierta | --- | |
| 2025-07 | Evaluación de las biotoxinas marinas en la zona norte de Chile, como herramienta de adaptación al cambio climático | | Licitación cerrada | --- | |
| 2018-14 | Determinación de la situación sanitaria base de moluscos bivalvos nativos de importancia comercial en Chile | Pontificia Universidad Católica de Valparaíso | Terminado | Moluscos - Almeja - Macha - Navaja - Navajuela - Ostión del norte - Ostra chilena | Informe final |
| 2018-52 | Análisis del estado de la situación mundial y proyecciones de la producción y uso de Organismos Genéticamente Modificados con énfasis en la acuicultura | Universidad de Concepción | Terminado | --- | Informe final |
| 2020-14 | Desarrollo de una propuesta de programa de vigilancia epidemiológica basada en riesgo para peces ornamentales en Chile, en función de su caracterización y condición sanitaria actual | Instituto de Fomento Pesquero | Terminado | Peces | Informe final |
| 2020-08 | Validación de técnicas de inactivación de las principales microalgas causantes de FAN | Instituto de Fomento Pesquero | Terminado | Plaga:Alexandrium catenella | Informe final |
| 2021-12 | Revisión, actualización y mejoramiento de los ensayos de cohabitación, que forman parte del Estudio Sanitario con Efectos de Impacto Ambiental requerido en el marco la Internación de especies de primera importación (D.S. (MINECON) N° 730 de 1995) | Instituto de Fomento Pesquero | Terminado | --- | Informe final |
| 2023-01 | Caracterización y evaluación ecológica y genética de los bancos naturales de mitílidos y su aporte a la disponibilidad de larvas para la actividad de colecta de semillas, Etapa 1: Fiordo Reloncaví y comunas de Hualaihué y Castro | Universidad Austral de Chile | Terminado | Moluscos | Informe final |
